Characterization and expression of the coat protein-coding region of banana bract mosaic potyvirus, development of diagnostic assays and detection of the virus in banana plants from five countries in southeast Asia

• Authors : Rodoni, B.C.; Dale, J.; Harding, R.


• Document type : Journal article


• Year of publication : 1999


• Journal title : Archives of Virology


• Volume (number) : 144 (9)




• Pages : 1725-1737


• Peer-reviewed : Yes


• ISSN : 0304-8608; 1432-8798


• Language(s) : English


• Abstract : We have sequenced the entire coat protein (CP)-coding region and 5' 162 nucleotides of the 3' untranslated region (UTR) of nine different isolates of banana bract mosaic virus (BBrMV) from five different countries. Further, we have sequenced the 3' 621 nucleotides, of the NIb-coding region of a Philippines isolate. This is the first report of BBrMV in Thailand, Vietnam and Western Samoa. When the sequences of the CP-coding region and 3' UTR were compared to each other, variability of between 0.3 percent and 5.6 percent, and 0.3 percent and 4.3 percent, was observed at the nucleotide and amino acid levels, respectively. Phylogenetic analysis of the BBrMV isolates did not reveal any relationship between the geographic location of the isolates. The BBrMV CP was expressed in Escherichia coli as a fusion protein and the purified recombinant protein was used to produce a high titre BBrMV-specific polyclonal antiserum. This antiserum was used to develop a F(ab')2 indirect double antibody sandwich ELISA and compared with immuno-capture PCR (IC-PCR) and reverse transcription PCR (RT-PCR) assays for BBrMV detection. RT-PCR was shown to be the most sensitive test followed by ELISA and IC-PCR (Author's abstract).
  
  [Caractérisation et expression de la région codant pour la protéine de l'enveloppe du potyvirus de la mosaïque de la bractée du bananier, développement d'un diagnostic et détection du virus dans des bananiers provenant de cinq pays d'Asie du Sud-Est]
  
  [La région complète codant pour la protéine de l'enveloppe (PE) a été séquencée ainsi que 162 nucléotides en 5' de la région 3' non traduite (RNT) de 9 isolats différents du virus de la mosaïque de la bractée du bananier (BBrMV) provenant de cinq pays différents. De plus, les 621 nucléotides en 3' de la région codant NIb d'un isolat philippin ont été séquencés. C'est le premier rapport sur le BBrMV en Thaïlande, au Viêt Nam et dans les Samoa occidentales. La comparaison des séquences de la région codant PE et la 3' RNT fait entrevoir une variabilité nucléotidique (0.3 pourcent à 5.6 pourcent), et des acides aminés (0.3 pourcent à 4.3 pourcent). L'analyse phylogénétique des isolats BBrMV ne révèle aucune corrélation avec la localisation géographique des isolats. La PE BBrMV a été exprimée dans Escherichia coli comme une protéine de fusion et la protéine recombinante purifiée a été employée pour produire un antisérum polyclonal BBrMV-spécifique de titre élevé. Cet antisérum a servi à développer un ELISA double anticorps indirect F(ab')2 qui a été comparé à des essais en immuno-capture PCR (IC-PCR) et en transcription reverse PCR (RT-PCR) pour la détection du BBrMV. La RT-PCR s'est révélée le test le plus sensible suivi par ELISA et IC-PCR (Résumé d'auteur).]
  
  [Caracterización y expresión de la región codificadora de proteína de revestimiento del potivirus del mosaico de las brácteas de banano, desarrollo de los ensayos de diagnóstico y detección del virus en las plantas de banano procedentes de cinco países en el sudeste de Asia]
  
  [Hemos secuenciado la región codificadora entera de la proteína de revestimiento (CP) y nucleótidos 5' 162 de la región 3' sin traducir (UTR), de nueve diferentes aislados del virus del mosaico de las brácteas de banano (BBrMV) procedentes de cinco países diferentes. Además, hemos secuenciado los nucleótidos 3' 621, de la región codificadora de Nib de un aislado procedente de Filipinas. Este es el primer informe sobre la aparición del BBrMV en Tailandia, Vietnam y Samoa Occidental. Cuando las secuencias de la región codificadora de CP y UTR 3' fueron comparadas entre sí, se observó la variabilidad a niveles de nucleótidos y aminoácidos de entre 0.3 porciento y 5.6 porciento, 0.3 porciento y 4.3 porciento, respectivamente. El análisis filogénetico de los aislados del BBrMV no reveló relaciones algunas entre las ubicaciones geográficas de los aislados. La CP del BBrMV fue expresada en Escherichia coli como una proteína de fusión y la proteína recombinante purificada fue utilizada para producir un antisuero policlonal de alta titulación, específico del BBrMV. Este antisuero fue utilizado para desarrollar una prueba ELISA indirecta de sandwich doble de anticuerpos F(ab')2 y comparado mediante la PCR de inmunocaptación immuno-capture PCR (IC-PCR) y PCR de transcripción inversa (reverse transcription PCR, RT-PCR) para la detección del BBrMV. Se demostró que el RT-PCR fue la prueba más sensible seguida por ELISA e IC-PCR (Resumen del autor).]


• Keywords : PLANT VIRUSES; MOLECULAR GENETICS; ELISA; PCR; IMMUNODIAGNOSIS; REVERSE TRANSCRIPTASE; POTYVIRUSES; INDIA; PHILIPPINES; THAILAND; SOUTH EAST ASIA; SAMOA; VIETNAM


• Open access : No


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