Serological and genomic heterogeneity of banana streak badnavirus : implications for virus detection in Musa germplasm

• Chapter Authors : Lockhart, B.E.L.; Olszewski, N.E.


• Document type : Conference paper


• Year of publication : 1993


• Conference : International Symposium on Genetic Improvement of Bananas for Resistance to Diseases and Pests, Montpellier, France, 1992/09/7-9


• Book title : Breeding banana and plantain for resistance to diseases and pests


• Editors : Ganry, J.


• Publisher(s) : CIRAD-FLHOR


• Place of publication : Montpellier, France


• Pages : 105-113


• Language(s) : English


• Abstract : Three serological and genomically distinct badnavirus strains associated with Banana Streak Virus (BSV) have been isolated to date: BSV-MA (Moroccan strain), BSV-Rw (Rwandan strain) and BSV-My (Trinidad Mysore strain). Germplasm indexing of bananas using crossed reactions between the strains in serological and nucleic acid hybridisation tests is not possible because of the absence of such reactions. Oligonucleotides were found and tested that initiated PCR amplification for most badnavirus, including the three BSV strains. A strategy based on amplification by PCR appears to be the most reliable method for the detection of all members with polymorphism close to the badnavirus group, including those of BSV.
  
  [Hétérogénéité génomique et sérologique du badnavirus associé à la "mosaïque en tirets du bananier" (BSV). Conséquences pour sa détection dans le matériel végétal de Musa]
  
  [Trois souches du badnavirus associé à la "Mosaïque en tirets du bananier" (BSV), distinctes sur le plan sérologique et génomique, ont été isolées jusqu'à présent : BSV-MA (souche marocaine), BSV-Rw (souche du Rwanda) et BSV-My (souche de Trinidad Mysore). En raison de l'absence de réactions croisées entre ces souches lors d'essais sérologiques et d'hybridation d'acides nucléiques, l'indexation du matériel génétique bananier par ces méthodes est inopérante. Nous avons trouvé et testé des oligonucléotides qui initient une amplification par PCR pour la majorité des badnavirus, incluant les 3 souches de BSV. Une stratégie basée sur l'amplification par PCR paraît la méthode la plus fiable pour détecter tous les membres ayant un polymorphisme proche du groupe des badnavirus, y compris ceux du BSV.]
  
  [Heterogeneidad serológica y genómica del badnavirus asociado al virus del rayado del banano (BSV). Implicaciones de la detección del virus en el germoplasma de Musa]
  
  [Hasta ahora han sido aisladas tres cepas de badnavirus asociadas al virus del rayado de banano (BSV), distintas desde el punto de vista serológico y genómico: BSV-MA (cepa marroquina), BSV-Rw (cepa de Ruanda) y BSV-My (cepa de Trinidad, Mysore). La indización de germoplasma utilizando reacciones cruzadas entre las cepas en las pruebas de hibridación en ácido serológico y nucleico no es posible, debido a la ausencia de tales reacciones. Hemos encontrado y examinado los oligonucleótidos que iniciaban una amplificación por PCR para la mayoría de los badnavirus, incluyendo las 3 cepas del BSV. Una estrategia basada en la amplificación por PCR parece ser el método más confiable para la detección de todos los miembros con polimorfismo cercanos al grupo de los badnavirus, incluyendo los del BSV.]


• Keywords : GERMPLASM; IDENTIFICATION; PLANT VIRUSES; BANANA MOSAIC; PCR; SEROTYPES; USA; TRINIDAD AND TOBAGO; RWANDA; MOROCCO


• Open access : Yes


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• Musalit document ID : FA950044

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